一个如今还存在着忍者的世界中，古代忍者的雇主，是政治家、大企业的干部们。持有弱小权利的人当中，有著一些将忍者当作满足本人愿望的道具的人存在。为了对立这些在黑暗中的“恶忍”，政府开端执行了某个方案―“善忍”―也就是养成属於国度的忍者的机密方案。为了养成“善忍”而成立的机构，“内阁间谍谍报部一课付特殊秘密谍报员养成所”，通称、忍学科。在拥有一千名先生的名门升学学校“国立半藏学院”中，不为人知的内面。为了与罪恶战役，“善忍”们贡献本人的青春，正在“国立半藏学院”忍学科中就读的五名少女，鼓起勇气与恶忍战役。五位女忍者性情各异，她们辨别是飞鸟、斑鸠、葛城、柳生、云雀。